Capitale administrative, première ville du monde avec plus d'un million et demi d'habitants, Edo est le siège du Bakufu. La ville est divisée en deux grandes parties. Les hauteurs de la ville sont réservées aux Daimyos et leurs samouraïs. À l'abri des inondations et des désagréments des anciens marais, ces quartiers sont le symbole du pouvoir. À l'inverse, la ville basse regroupe le petit peuple vivant dans de petites masures en bois et en bambou.

Véritable "garde-manger du monde", Osaka est une ville d'envergure internationale qui rassemble et livre toutes sortes de marchandises. Premier pôle économique du pays, le prix du riz fixé au marché de Dojima est reconnu comme le prix étalon pour tous les marchés du Japon. Parallèlement au développement commercial, la culture populaire est florissante.

Lieu de rencontre privilégié entre les japonais occidentaux et orientaux, son temple abrite nombre de moines. Samouraïs et riches marchands composent une large part de la population. L'imposant château de Nagoya abrite le fils du shogun.

Mito, soit "La porte de l'eau", est traversée par la rivière Naka qui sert au transport fluvial. Elle est célèbre pour son vaste jardin public, le Kairaku, considéré comme l'une des belle composition végétale du pays. La ville est aussi réputé pour son natto. Les daimyos de Mito comptent parmi les plus fidèles vassaux du shogun.

Capitale du Japon, Kyoto est la ville Impériale, la ville de l'Empereur, la ville aux 7 palais. Centre de pèlerinage, moines et gardes impériaux sont en majorité à Kyoto.